医院学科门类齐全，专科特色明显。医院拥有普通外科、内分泌科、神经内科、肾病内科、耳鼻咽喉科等5个国家级重点学科，内分泌科、普通外科、泌尿外科、中医肝病科、感染病科、风湿免疫科、临床护理等7个国家临床重点专科建设项目，以及血液内科、神经外科、骨科、神经内科、急诊科、检验科、耳鼻喉科、产科、麻醉科、康复科、病理科、口腔科、皮肤科、肾内科、儿科、消化内科、医学影像科、感染科、临床护理、呼吸内科、普通外科、泌尿外科、中医肝病、风湿免疫科、内分泌科等25个广东省临床重点专科。肝脏病学科是医院的龙头学科，目前已形成涵盖肝脏内科、肝脏外科、重症监护、肝脏影像与介入治疗、肝病实验室等多学科综合诊疗和临床科研的强势学科群;风湿内科、介入血管科、精神科、儿童行为发育专科等特色学科，不但在广东省、华南地区享有盛誉，在全国均有一定影响。
作为中山大学医学部的主要临床教学基地，医院拥有临床医学硕士点37个，博士点26个，博士后流动站2个，住院医师规范化培训基地14个，硕士生导师170人，博士生导师58人，承担了多学科的本科生、研究生以及全国各地进修生的临床教学任务。医院传染病学是国家精品课程、国家双语教学示范课程、教育部来华留学英语授课品牌课程、广东省教学团队;不育与性医学科是国家级精品视频公开课程;精神病学、皮肤性病学、康复医学、诊断学、妇产科学、性医学、外科学、内科学是中山大学精品课程。
医院着力打造高水平科研基地和优质学术平台，拥有省部级重点实验室3个，省部级研究中心4个，厅局级实验室及研究中心3个，国家药物临床试验资格认定专业8个;主办和承办了《新医学》、《器官移植》、《中华腔镜泌尿外科杂志(电子版)》及《中华肝脏外科手术学电子杂志》等国家级杂志。此外，我院教授还担任《中华介入放射学电子杂志》和《中华糖尿病杂志》的总编辑。近三年来，我院获得各级科研项目500余项，经费总额超过1亿元，以我院为第一作者单位在sci收录期刊上发表文章400余篇，一系列高水平论文发表在世界权威学术杂志上。此外，我院专家团队牵头或参与的重大科研项目也先后获得国家科技进步一等奖、广东省科技进步一等奖等重大荣誉。
与此同时，医院配备有 mr、dsa、ct、ct-pet、乳腺x光机、彩色多普勒诊断仪、骨密度仪、大型生化自动分析仪，以及中央重症监护系统、百级层流手术室、人工肝支持系统等...