医院现有在职职工172人，其中高、中级卫生专业技术人员63人，编制床位100张。设有内科、外科、妇产科3个临床科室(五个病区)，4个医技科室，门(急)诊部设有急诊科，还有内科、等14个专科、专病门诊，以满足不同患者的诊疗需求。设有社区保健科，为机场周边社区群众进行预防保健、诊疗及家庭病床服务，设有专门体检机构，可以开展不同种类、不同档次的健康体检。
多年来，民航广州医院以为健康人提供完美的身心保健服务，为病人提供满意的医疗急救服务，为航空安全提供快速到位的应急救护为目标，多方位提升软、硬件基础。现已具备计算机管理局域网，拥有螺旋ct扫描仪、ge数码850max光机、自动生化分析仪、彩色多普勒诊断仪、人工肾脏透析仪、内窥镜系统、腹腔镜系统、椎间盘镜系统、前列腺电切割仪、心脏监护系统、全功能麻醉机、三辆配备先进的复苏型救护车等设备，为提高临床的诊治水平和航空应急救护的保障能力创造成了有利的条件。